自凤林珪公逝去到元朝灭亡，计三十三年（1335-1368年）。这期间的少林寺住持有：息庵义让，1336-1340年住持；损庵洪益，1340年住持；无为法容，约1341-1343年住持；淳拙文才，1345-1352年第二次任住持；海印，约1354年前后任住持；嵩溪子定，1360-1362年、1368-1369年两次任住持，是元末最后一任住持。其中，无为法容没有详细资料可供稽考，海印也只知他还曾任过洛阳天庆寺住持，别无资料可寻。息庵(1284-1340)，法名义让，真定（今河北省正定县）人，俗姓李氏。据说生而颖异，志气不群。幼年即入本府华严寺，札相阇梨（即法师之义）薙落。受具足戒后，投身讲肆，听习《华严经》，又遍游燕赵大地，参扣玄旨。后入封龙山禅房寺，入古岩就公之室。古岩甚称赏之。未几，古岩应山东长清灵岩寺之请，息庵也随之侍从。古岩为少林寺住持时（1313-1317年），息庵也随至少林寺，晨夕参请，机缘相契，乃密付衣颂，使续洞上宗风，且令他担任书记之职。古岩去世，息俺便南下南阳香岩禅寺（河南省淅川县白岩山中），为维那之职。又司记室于宝丰县香山寺，做首座于嵩山法王寺。至治二年（1322年），开堂于洛阳天庆寺，时年三十九岁。又迁熊耳山空相寺和山东灵岩寺，凡所住之处，革故鼎新，百废俱举。至元丙子年（1336年）秋天，他受请为少林寺住持，一任五年（1336-1340年）。息庵在少林寺除传道扬化之外，更注重于庄严法社之举。妆銮殿宇，修整仓库、庄园、水井、寮房，祖刹为之改观，仓储十倍于常。不想竟劳顿致疾。息庵自知垂危，命门人营造灵塔。后至元庚辰（1340年）五月十二日，他召集八大执事及门人等付于后事，遂索笔书偈日“来时本静，去亦圆周。虚空作舞，任意优游。”掷笔右胁而逝，时年五十七。火葬以后，门人分灵骨起塔于少林寺和灵岩寺两处。息庵有门弟子百余人，可嗣法者十二人。息庵去世后，请谁继任为住持，一直举棋不定。七月，四大班首和八大执事商议用抓阄的方式占卜一下。结果，三次占卜的结果都是损庵洪益（即益吉祥）。他们愕然日：“这大概是鼻祖（菩提达摩）之意吧!”于是，备好疏文和钱币，派出专使去湖北，一定要请损庵老和尚来少林寺。损庵洪益(1263-1340)，应山人，俗姓徐氏，十五岁八石龙山宝林寺，投普善老师(1260-1335)出家，后遍参宗匠，得法于白云治公。损庵历主名刹。大德三年（1299年）主宝林寺，十一年（1307年）主法王寺，至大四年（1311年）主邢台大开元寺，累朝宠命，并于延祜丙辰（1316年），特授中奉大夫、制加“圆照普门光显大禅师”之号，赐以二品银章，金斓袈裟，总管宗门之事。元英宗临柞（1321年），曾下诏褒美。损庵遂于泰定乙丑，赴阙谢恩。明年(1326年)，又加特旨表彰。至顺庚午（1330年），损庵辞去大开元寺住持，归山养闲，但壬申年（1332年）又被下诏征还。至元统甲戌（1334年），力辞得逞，在寺西堂怡然自适。他曾有诗：“奠将世事累青眼，留取闲云伴白头”，被人争相传诵。不久，他回到石龙山，杜门却扫，澹泊世味。但学徒填谷，纷然而至。损庵咸与奖抑，淬厉以器之。损庵以“了一真妙，断诸缘想”为念，未尝以富贵二字人心。他持律严格，布衣粝食，蒲团竹几，甘淡苦节，几十年都是坐着入睡，所谓“胁不至席者数十余年”。他还认为，修佛坐禅，“佛”与“魔”同样是关键。损庵宏正知见，宴坐觉场，摄化四众，一时事迹彰于江汉，美声闻于中原。专使到达应山县石龙山宝林寺后，拜访损庵，说明来意。损庵引颈唱然日：“吾今耄矣，旦夕之人耳。你快快回去，不要再多说了！”专使祈求哀告了十多天，并向损庵表示不会以寺务相累，只恳请到少林寺主持宗盟。最后，七十八岁的损庵终于答应了。他与专使一同北上，大约在八月间到达少林寺。损庵住持的消息传开，衲子辐辏，玄风丕变。一时龙象，争奔席下。但到了十二月十六日，损庵吩咐把自己的衣钵、财务留给常住诸僧。十九日，他沐浴更衣，挝鼓升座，给寺众们讲解“无生忍”的意义。他说：“无生无灭的诸法实相，就是‘无生’；彻悟此道，了法无生，就是无生忍。我已快证我的无生身了!”言毕，众僧号哭动情，请他留世。他瞪目叱日：“大无生身会重生！”乃闭目跏趺而逝。弟子及寺僧们祭奠七日夜。据说火葬时，祥光烛空，收舍利如豆粒大者，不可计数。依损庵遗嘱，建塔于应山石龙山宝林寺的北原和少林寺塔林。损庵洪益卒年七十有八，法腊六十四。徒七十余人，嗣法者二十余人。“损庵碑”，今存湖北省应山县北十公里的宝林寺北原上，由蒙古人“中顺大夫、德安府达鲁花赤（蒙语，意为镇守使）兼劝农事迷尔哈赤”立石。